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客观的H&E切片自动分析。
客观的PAS切片自动分析。
客观的切片分析,能够避免人为主观分析的各种缺点,比如(1)相对随意的切片区域选择;(2)不同分析人员之间的标准差异;(3)同一分析人员不同时间的标准差异等,因此可以保证结果的可重复性。
1. 客观的H&E切片自动分析流程
1.1 理论基础
各种原因导致的炎症都伴随白细胞的浸润1,或直观理解为病灶部位细胞增多,其通常通过H&E切片染色进行鉴别2。
本流程通过计数H&E切片中的相对细胞(核)总数和相对细胞核总面积,以实现客观的H&E切片自动分析。
1.2 流程和实例
说明:示例所用组织切片使用3DHISTECH公司出品的Pannoramic 250 FLASH数字病理切片扫描仪进行扫描,采用20×明场物镜,获得全幅高分辨率数字图像,并保存为.mrxs格式以供分析。
2. 客观的PAS切片自动分析流程
2.1 理论基础
PAS染色主要用于染色含有高比例碳水化合物(包括糖原)的结构3,比如用于小鼠肺哮喘模型的粘液分泌鉴别4。
本流程通过计数PAS切片中的相对PAS阳性颗粒总数和相对PAS阳性颗粒总面积,以实现客观的PAS切片自动分析。
2.2 流程和实例
说明:示例所用组织切片使用3DHISTECH公司出品的Pannoramic 250 FLASH数字病理切片扫描仪进行扫描,采用20×明场物镜,获得全幅高分辨率数字图像,并保存为.mrxs格式以供分析。
References
1.
Coussens, L. M. & Werb, Z. Inflammation and cancer. Nature 420, 860–867 (2002).
2.
Haan, K. de et al. Deep learning-based transformation of h&e stained tissues into special stains. Nature Communications 12, (2021).
3.
Singh, I., Weston, A., Kundur, A. & Dobie, G. Chapter 1 - introduction. in Haematology case studies with blood cell morphology and pathophysiology 1–8 (Elsevier, 2017). doi:10.1016/b978-0-12-811911-2.00001-5.
4.
Khumalo, J., Kirstein, F., Scibiorek, M., Hadebe, S. & Brombacher, F. Therapeutic and prophylactic deletion of IL‐4Ra‐signaling ameliorates established ovalbumin induced allergic asthma. Allergy 75, 1347–1360 (2020).